Ongeveer 1-2 uur na het consumeren van San Pedro zal de werkzame stof mescaline voelbaar worden en zal dit zich openbaren aan de gebruiker. De effecten kunnen dan 8-15 uur aanblijven. Deze effecten zijn onder andere: extreme lichtgevoeligheid; je zult in staat zijn iedere lichtstraal te kunnen zien en voelen en zelfs mensen en dingen te zien ‘stralen’. Verloren herinneringen kunnen terugkeren en je kunt geluiden horen en dingen zien die van ver komen. Al met al staan je zintuigen verder open om meer te kunnen ervaren van je omgeving en kun je alles gaan zien in een ‘goddelijk licht’. Verder kunnen allerlei emoties naar boven komen zoals lachen, huilen, schreeuwen, plezier, angst en liefde. Liefde voor alles wat is en alles wat niet is.
De effecten van San Pedro zijn op verschillende manieren aangenamer dan die van Peyote (dit is een andere cactussoort die ook mescaline bevat). Om te beginnen is de smaak minder bitter en de gebruikelijke misselijkheid verschijnt niet per definitie. Wanneer dan de psychotropische ervaring plaatsvindt is deze minder overweldigend, meer kalm en niet zo fysiek als die van Peyote.